كودو شينتشي هو متحرٍ في المدرسة الثانوية ذاع صيته لحله العديد من القضايا الصعبة، وهو ابن مؤلف الروايات الغموض العالمي، كودو يوساكو. يتورط شينتشي في حادثة مع رجال منظمة غامضة ذوي رداء أسود، ويجبرونه على تجرع عقار غريب بقلص جسده، فيصبح إيدوغاوا كونان. على شينتشي الآن الانتقال لمنزل صديقة طفولته، موري ران، حيث يعمل والدها متحرياً لإيجاد معلومات عن أولئك الرجال.