يتناول العمل قيام الولايات المتحدة بإرسال العميل السري (ليون كينيدي) إلى أحد بلدان شرق أوروبا الصغيرة للتأكد من شائعات تفيد باستخدام أسلحة بيولوجية مدمرة في أحد الصراعات، يتأكد بالفعل، لكن… 

كايتو كيد يظهر في هذا الفلم ويحاول سرقة خاتم الممثلة “جولي” لذلك يقوم بالتنكر بشخصية سينشي كودو (أو كونان) ولكن في النهاية لم يتمكن كونان من الإمساك به ونجح كيد… 

في أنقاض مدينة غريبة، تعتني فتاة صغيرة ببيضة كبيرة تحملها بحرص بين ذراعيها. وتلتقي برجل يبحث عن طائر رآه في حلمه.

أثناء زيارة كلٍّ من كونان وران وسونوكو سوزوكي وفريق المتحرين الصغار برفقة الدكتور أغاسا لبُرج Bell Tree Tower ذو الـ635 مترًا الذي لم يُفتتح للجميع بعد، يقوم قناص مجهول فجأة… 

بعد إلقاء القبض عليه بتهمة محاولة اغتيال رايكاجي ، زعيم كوموغاكوري ، وكذلك قتل جنين من كيريغاكوري وإواغاكوري ، سُجن ناروتو في هوزوكيجو: مرفق احتواء إجرامي يُعرف باسم سجن الدم.… 

هيجي وسينشي يتعاونان معاً في حل لغز معقد لرسالة من مصدر مجهول والتي ستقود للتمثال المفقود منذ 8 سنوات

بعد سبع سنوات من حادثة تدمير (مدينة الراكون)، يقوم رجل جريح القلب جراء فقدان حبيبته في المدينة المحطمة بنشر وباء (تي – فايروس) في المطار. ويتولي الوكيل الخاص (ليونز كيندي)… 

القصة تدور حول D، سيئة السمعة “dunpeal” (ولد من أب وأم مصاصي الدماء البشرية) منبوذا والشهير صياد مصاص دماء. بسالته في صيد مخلوقات الليل السماح له القبول بين البشر، ما… 

كونان وران وفرقة المتحرين الصغار وآخرون يذهبون إلى مملكة الثلوج وفي بداية الأمر يتلقى محافظ طوكيو رسالة تهديد غامضة وفى نفس اليوم ستنفجر قنبلة في مترو الأنفاق الذي افتتح حديثا.

يدخل كونان وأصدقائه في لعبة خيال علمي اسمها “كوكون”, ولكن يحدث أمر غريب وهو سيطرة برمجية اسمها سفينة نوح (بالإنجليزية: Noah’s Ark) على نظام التحكم في اللعبة. يبدأ كونان وأصدقائه…