أمرت سيلي بشن هجوم شامل على نيرف، بهدف تدمير الإيفا قبل أن يتمكن غيندو من تطوير خططه الخاصة لمشروع الواسطة البشرية. يتم دفع شينجي إلى أقصى حدود عقله لأنه مجبر… 

عندما تندلع زهرة غريبة ضخمة تُعرف باسم “دارول” بشكل غير متوقع في حدث مميت، وتطلق العنان لمخلوقات وحشية تهلك سكان اليابان، تقع ريتا وسط الدمار وتُقتل. ولكن بعد ذلك تستيقظ… 

خرجت حياة إيروها عن مسارها عندما انتقلت كاغويا، الهاربة من القمر، وأقنعتها بالأداء في عالم افتراضي معًا.